医药供应链流通环节的压缩，将会对医药流通企业产生直接的影响，大型医药流通企业从中受益。“两票制”实施后，医药流通企业将直接连接上游医药生产企业和下游零售终端，在医药供应链中承担信息流、物流、资金流的枢纽作用。物流方面，医药流通企业连接着上游医药生产企业，承担货物的集散、配送和渠道库存作用；信息流方面，医药流通企业直面下游医疗机构等终端客户，既能帮助上游医药生产企业实现“以销定产”的物料生产计划，又能实现医疗终端市场的信息收集和反馈，不断调整产品策略；资金流方面，为保障医药供应链的正常运转，医药流通企业需协助生产企业降低应收账款，保障其现金流，承担医院到厂家这一过程中的资金垫付功能。
　　同中小型流通企业相比，大型医药流通企业的优势在于：具备强大的资金垫付能力，可保障上游药企的应收账款；具备符合GSP规范的仓储、配送和终端网络覆盖；有强大的商务和销售团队支持保障药品的渠道管理。可以预见，“两票制”的推行将引发医药流通企业的集聚整合：未来，会有越来越多的医药流通企业会因业务减少、合规检查吊销执照等原因，面临被收购、转型或者淘汰的前景。从长远来看，医药流通行业经营环境将会不断改善，行业集中度将会持续提高。